В 1530 году Виньола начинает работать над трактатом
«Правило пяти ордеров архитектуры». Эта работа была закончена в 1562 году и на протяжении трёхсот лет являлась основополагающей при изучении
ордерной системы. Как и трактаты Палладио, книга Виньолы стала основным источником, из которого об архитектуре Возрождения узнавали за пределами Италии.
В 1550-е гг. Виньола под руководством Микеланджело возводил два малых купола на соборе Святого Петра, а после смерти мастера возглавил работу над собором. В 1540 году Виньола отправляется во Францию, где совместно с другими архитекторами работает на строительстве дворца в
Фонтенбло. Именно после строительства этого дворца мода на
маньеризм распространилась по Европе.